Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA7P31268 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms