Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms