Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB9P28065 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms