Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GCSHP23434 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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GCSHP23434 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GCSHP23434 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GCSHP23434 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GCSHP23434 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GCSHP23434 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GCSHP23434 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GCSHP23434 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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