Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDKP21741 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDKP21741 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDKP21741 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDKP21741 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDKP21741 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms