Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD53P19397 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD53P19397 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD53P19397 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD53P19397 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD53P19397 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD53P19397 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD53P19397 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms