Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC130P13994 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC130P13994 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms