Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCG2P13521 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCG2P13521 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCG2P13521 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCG2P13521 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG2P13521 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG2P13521 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG2P13521 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG2P13521 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG2P13521 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG2P13521 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms