Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP1P11387 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1P11387 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1P11387 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1P11387 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1P11387 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1P11387 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1P11387 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1P11387 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1P11387 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1P11387 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1P11387 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP1P11387 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP1P11387 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1P11387 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1P11387 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1P11387 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1P11387 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1P11387 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1P11387 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1P11387 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1P11387 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP1P11387 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP1P11387 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP1P11387 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP1P11387 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms