Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms