Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms