Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP3P08254 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP3P08254 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP3P08254 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP3P08254 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP3P08254 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP3P08254 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP3P08254 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP3P08254 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP3P08254 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP3P08254 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP3P08254 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP3P08254 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP3P08254 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP3P08254 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP3P08254 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP3P08254 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms