Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPBP07199 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPBP07199 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPBP07199 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPBP07199 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPBP07199 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPBP07199 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPBP07199 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPBP07199 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPBP07199 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPBP07199 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPBP07199 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPBP07199 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPBP07199 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPBP07199 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPBP07199 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPBP07199 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPBP07199 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPBP07199 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPBP07199 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPBP07199 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPBP07199 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPBP07199 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPBP07199 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPBP07199 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPBP07199 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPBP07199 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPBP07199 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPBP07199 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPBP07199 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPBP07199 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPBP07199 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPBP07199 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPBP07199 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPBP07199 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms