Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYBBP04839 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYBBP04839 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYBBP04839 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYBBP04839 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYBBP04839 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYBBP04839 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYBBP04839 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYBBP04839 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYBBP04839 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYBBP04839 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYBBP04839 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYBBP04839 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYBBP04839 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYBBP04839 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYBBP04839 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms