Protein–RNA interactions for Protein: P02675

FGB, Fibrinogen beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGBP02675 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGBP02675 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FGBP02675 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGBP02675 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGBP02675 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGBP02675 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGBP02675 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGBP02675 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGBP02675 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGBP02675 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGBP02675 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGBP02675 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGBP02675 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGBP02675 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGBP02675 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGBP02675 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGBP02675 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGBP02675 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGBP02675 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGBP02675 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGBP02675 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms