Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP1P01033 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms