Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASS1P00966 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASS1P00966 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ASS1P00966 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASS1P00966 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASS1P00966 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASS1P00966 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASS1P00966 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASS1P00966 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASS1P00966 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASS1P00966 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASS1P00966 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASS1P00966 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ASS1P00966 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASS1P00966 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASS1P00966 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASS1P00966 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ASS1P00966 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASS1P00966 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASS1P00966 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASS1P00966 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASS1P00966 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ASS1P00966 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ASS1P00966 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASS1P00966 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASS1P00966 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASS1P00966 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASS1P00966 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASS1P00966 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASS1P00966 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASS1P00966 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASS1P00966 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASS1P00966 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASS1P00966 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASS1P00966 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms