Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STAMBPO95630 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
STAMBPO95630 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STAMBPO95630 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STAMBPO95630 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STAMBPO95630 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
STAMBPO95630 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms