Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPM3O75607 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPM3O75607 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPM3O75607 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPM3O75607 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NPM3O75607 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NPM3O75607 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPM3O75607 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPM3O75607 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPM3O75607 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPM3O75607 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPM3O75607 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPM3O75607 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPM3O75607 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPM3O75607 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPM3O75607 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPM3O75607 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NPM3O75607 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPM3O75607 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPM3O75607 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPM3O75607 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPM3O75607 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPM3O75607 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPM3O75607 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPM3O75607 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPM3O75607 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPM3O75607 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPM3O75607 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPM3O75607 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPM3O75607 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPM3O75607 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPM3O75607 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms