Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCATO75600 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCATO75600 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCATO75600 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCATO75600 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCATO75600 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCATO75600 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCATO75600 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCATO75600 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCATO75600 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCATO75600 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCATO75600 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCATO75600 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCATO75600 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCATO75600 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCATO75600 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCATO75600 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCATO75600 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCATO75600 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCATO75600 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCATO75600 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCATO75600 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms