Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 DUS3L-208ENST00000590110 977 ntTSL 218.88■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.82■□□□□ 0.61e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 NXF1-216ENST00000533499 936 ntTSL 518.79■□□□□ 0.61e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.581e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 JMJD6-201ENST00000303996 1893 ntTSL 218.58■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GMPPA-208ENST00000455657 907 ntTSL 518.55■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PRKAR1B-209ENST00000478198 602 ntTSL 318.49■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SH2D6-208ENST00000488219 509 ntTSL 318.42■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 MIR193BHG-208ENST00000641175 619 nt18.4■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GATD1-213ENST00000532320 1273 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GMPPA-207ENST00000443704 1783 ntTSL 518.23■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RNF167-212ENST00000575400 858 ntTSL 318.16■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 DUS3L-203ENST00000585587 895 ntTSL 518.16■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-219ENST00000567582 556 ntTSL 418.1■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SH2D6-205ENST00000477170 699 ntTSL 518.05■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CFLAR-211ENST00000439154 1310 ntTSL 1 (best)17.98■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.461e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GATD1-216ENST00000534603 863 ntTSL 1 (best)17.9■□□□□ 0.461e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GATD1-207ENST00000526650 457 ntTSL 317.86■□□□□ 0.451e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PANK4-205ENST00000486396 879 ntTSL 217.51■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TNK2-204ENST00000416152 2641 ntTSL 217.49■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KIF23-205ENST00000558346 1656 ntTSL 1 (best)17.48■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.381e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KAZALD1-204ENST00000477267 1096 ntTSL 517.3■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ENTPD6-208ENST00000427553 451 ntTSL 317.16■□□□□ 0.341e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 FAM214B-209ENST00000605392 585 ntTSL 417.08■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PGPEP1-207ENST00000597663 363 ntTSL 316.98■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZSWIM5-202ENST00000464588 390 ntTSL 316.9■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 DUS3L-213ENST00000592491 806 ntTSL 516.89■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-214ENST00000561260 628 ntTSL 316.84■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 HDAC5-206ENST00000587776 917 ntTSL 316.8■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ANKRD18DP-202ENST00000435620 2897 ntTSL 1 (best)16.54■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KIAA0895L-204ENST00000562514 512 ntTSL 516.54■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 AL365277.1-205ENST00000431553 497 ntTSL 316.52■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 DUS3L-210ENST00000590681 869 ntTSL 516.51■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KIAA0895L-203ENST00000561679 2824 ntTSL 216.5■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 MIR193BHG-201ENST00000570945 3219 ntTSL 316.48■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GUSBP11-202ENST00000430357 696 ntTSL 316.31■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 DMPK-213ENST00000598180 1626 ntTSL 216.26■□□□□ 0.197e-11■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GATD1-208ENST00000528309 510 ntTSL 316.19■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ADGRV1-227ENST00000640109 2906 ntTSL 516.16■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 DUS3L-206ENST00000589854 566 ntTSL 216.14■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 HDAC5-207ENST00000588261 846 ntTSL 316.02■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SIL1-204ENST00000503732 690 ntTSL 316.01■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZSCAN5A-215ENST00000592509 589 ntTSL 215.8■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 NXF1-214ENST00000533048 922 ntTSL 515.76■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RNF167-203ENST00000570492 766 ntTSL 315.7■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PLIN3-205ENST00000589163 1699 ntTSL 315.64■□□□□ 0.094e-16■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PRKAR1B-210ENST00000488474 617 ntTSL 315.62■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CD276-210ENST00000560928 2181 ntTSL 215.45■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.041e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 DGCR8-208ENST00000495351 508 ntTSL 415.3■□□□□ 0.041e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GATD1-211ENST00000529966 800 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 DTD1-203ENST00000618693 695 ntTSL 515.18■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 CYTH1-214ENST00000591095 1097 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 GATD1-214ENST00000532839 559 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PANK4-211ENST00000514922 568 ntTSL 215.07■□□□□ 01e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 PANK4-209ENST00000502770 1041 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 01e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RP1L1-201ENST00000329335 1536 ntTSL 214.86□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZNF598-208ENST00000567008 815 ntTSL 214.83□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SH2D6-206ENST00000481395 1416 ntTSL 514.76□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 WASHC3-204ENST00000535501 921 ntTSL 214.7□□□□□ -0.061e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RPS6KB1-205ENST00000472940 2808 ntTSL 214.61□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 SMYD2-204ENST00000471645 4732 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 RNF167-215ENST00000576452 589 ntTSL 514.5□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 BCKDK-210ENST00000567682 439 ntTSL 314.37□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 ZDHHC18-204ENST00000488397 1275 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 160.4
SF3B1O75533 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 160.4
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1372.5 ms