Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP2O75323 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms