Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIA3O75145 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIA3O75145 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms