Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBNO60934 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBNO60934 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBNO60934 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBNO60934 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBNO60934 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBNO60934 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBNO60934 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NBNO60934 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBNO60934 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBNO60934 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBNO60934 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBNO60934 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBNO60934 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBNO60934 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBNO60934 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBNO60934 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBNO60934 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBNO60934 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBNO60934 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBNO60934 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBNO60934 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBNO60934 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBNO60934 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBNO60934 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBNO60934 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBNO60934 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBNO60934 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBNO60934 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBNO60934 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBNO60934 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBNO60934 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBNO60934 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBNO60934 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBNO60934 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBNO60934 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBNO60934 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBNO60934 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBNO60934 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBNO60934 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms