Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
ABCC9O60706 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms