Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KIAA0556O60303 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms