Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRNO43815 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRNO43815 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRNO43815 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRNO43815 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRNO43815 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRNO43815 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STRNO43815 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRNO43815 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRNO43815 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRNO43815 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRNO43815 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRNO43815 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRNO43815 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRNO43815 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRNO43815 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRNO43815 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRNO43815 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRNO43815 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRNO43815 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRNO43815 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRNO43815 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRNO43815 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms