Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATMINO43313 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATMINO43313 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATMINO43313 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATMINO43313 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATMINO43313 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATMINO43313 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATMINO43313 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATMINO43313 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATMINO43313 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMINO43313 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMINO43313 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMINO43313 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMINO43313 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMINO43313 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMINO43313 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMINO43313 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMINO43313 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATMINO43313 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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