Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms