Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
VGFO15240 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VGFO15240 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VGFO15240 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VGFO15240 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VGFO15240 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VGFO15240 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VGFO15240 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VGFO15240 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VGFO15240 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VGFO15240 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VGFO15240 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VGFO15240 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VGFO15240 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VGFO15240 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VGFO15240 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VGFO15240 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VGFO15240 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VGFO15240 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VGFO15240 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VGFO15240 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VGFO15240 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VGFO15240 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VGFO15240 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VGFO15240 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VGFO15240 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VGFO15240 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VGFO15240 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VGFO15240 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VGFO15240 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VGFO15240 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VGFO15240 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VGFO15240 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VGFO15240 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VGFO15240 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
VGFO15240 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
VGFO15240 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VGFO15240 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VGFO15240 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VGFO15240 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VGFO15240 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VGFO15240 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
VGFO15240 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VGFO15240 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VGFO15240 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VGFO15240 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VGFO15240 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VGFO15240 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VGFO15240 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VGFO15240 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VGFO15240 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VGFO15240 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
VGFO15240 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VGFO15240 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VGFO15240 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VGFO15240 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VGFO15240 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VGFO15240 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VGFO15240 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
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