Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB6O15197 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms