Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3EO15041 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms