Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP2O00295 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP2O00295 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP2O00295 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP2O00295 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP2O00295 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP2O00295 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP2O00295 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP2O00295 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TULP2O00295 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TULP2O00295 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP2O00295 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP2O00295 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP2O00295 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP2O00295 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP2O00295 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP2O00295 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP2O00295 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP2O00295 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP2O00295 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP2O00295 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP2O00295 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP2O00295 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms