Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L13C9JLJ4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms