Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGPEP1LA6NFU8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms