Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLRN2A0PK11 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms