Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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