Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0D9SFI3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0D9SFI3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms