Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MORC2-201ENST00000215862 4469 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 BZW2-202ENST00000405202 1689 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NUP188-201ENST00000372577 5689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SLAMF8-201ENST00000289707 2996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC008014.1-203ENST00000611243 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RCAN1-207ENST00000481448 2816 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ZSCAN32-212ENST00000574940 2180 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CEP57L1-205ENST00000517392 2771 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CNIH4-202ENST00000366857 3963 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TOX4-203ENST00000448790 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 POLR3G-204ENST00000504930 3251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ERI2-201ENST00000300005 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MTFR1-201ENST00000262146 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ZNF561-202ENST00000326044 2017 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NRAP-202ENST00000360478 5426 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CPEB1-207ENST00000611031 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ARMC8-223ENST00000538260 4728 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ANXA7-202ENST00000372921 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ABCC11-204ENST00000394748 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CDC42SE1-202ENST00000439374 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CCL27-201ENST00000259631 446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LIN37-201ENST00000301159 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGKV1D-42-201ENST00000390278 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TCEAL4-202ENST00000415568 959 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC079779.2-202ENST00000427831 392 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LINC01718-201ENST00000441660 391 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 KRTAP19-10P-201ENST00000445258 187 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC005020.1-201ENST00000455459 526 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC092159.1-202ENST00000456255 389 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 PPIAP16-201ENST00000462517 487 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGKV1D-8-201ENST00000471857 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MARK2P6-201ENST00000494974 897 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGLVV-58-201ENST00000520445 304 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC104561.2-201ENST00000523257 519 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 BDNF-AS-209ENST00000532965 572 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AP000763.1-201ENST00000539481 325 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ADGRG1-203ENST00000540164 3820 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TIMM8B-204ENST00000541231 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL390254.1-201ENST00000554033 465 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC005670.1-201ENST00000572349 395 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LYPLA2P2-201ENST00000600506 676 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL137798.1-201ENST00000607700 339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RN7SL539P-201ENST00000610974 291 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RN7SL196P-201ENST00000614361 291 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 PSG3-206ENST00000614582 1287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL138995.1-201ENST00000614633 675 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 EDRF1-AS1-211ENST00000615461 592 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RN7SL286P-201ENST00000616519 291 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC091953.1-201ENST00000624775 296 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LPXN-202ENST00000528489 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ZNF623-202ENST00000501748 6759 ntAPPRIS P3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ASB15-201ENST00000275699 2706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 GRIK1-207ENST00000399914 3624 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MAGEB16-201ENST00000399985 1667 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SLC39A6-201ENST00000269187 3543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SLC10A5-201ENST00000518568 2568 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MSL3-202ENST00000337339 3446 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC114480.1-201ENST00000465933 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NONO-215ENST00000535149 2882 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 DACH2-202ENST00000373131 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NPHP1-202ENST00000355301 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ZIK1P1-201ENST00000456074 1459 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LCOR-209ENST00000540664 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SH3GLB1-201ENST00000370558 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 STRADA-230ENST00000638702 2140 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MITF-209ENST00000448226 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC005524.1-201ENST00000636857 1674 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 DCLK1-201ENST00000255448 5703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGSF3-201ENST00000318837 3842 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 S100A7A-201ENST00000329256 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MYOF-203ENST00000371488 763 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AIF1L-202ENST00000372297 418 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 OR52J3-201ENST00000380370 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 KRTAP13-3-201ENST00000390690 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC006378.1-201ENST00000426193 563 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL772155.3-201ENST00000444097 578 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TMBIM1-215ENST00000445635 1251 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 UBE2F-SCLY-201ENST00000449191 951 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RN7SL430P-201ENST00000464176 242 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LGI1-204ENST00000478763 600 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC011487.1-201ENST00000509280 887 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 C5orf66-203ENST00000513931 474 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AP001830.2-201ENST00000529278 494 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC092123.1-201ENST00000565623 871 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGHV1OR16-1-201ENST00000568055 392 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC016590.1-202ENST00000586324 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TTN-AS1-236ENST00000590040 855 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC000041.2-201ENST00000619824 151 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL391095.3-201ENST00000621084 720 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SNORA17B-202ENST00000626886 136 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC073869.5-201ENST00000635979 465 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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