Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MAP3K4Q9Y6R4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms