Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00312Q9Y6C7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms