Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD2APQ9Y5K6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD2APQ9Y5K6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms