Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB12Q9Y5F1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms