Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms