Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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SH3BP1Q9Y3L3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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SH3BP1Q9Y3L3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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SH3BP1Q9Y3L3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
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