Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms