Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FRMD4BQ9Y2L6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4BQ9Y2L6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms