Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINS2Q9Y248 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS2Q9Y248 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms