Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOD1Q9Y239 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms