Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HHLA3Q9XRX5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms